1巻
プロローグ、ジョナサンとディオの出会い・青春、ディオ:ジョースター卿の毒殺を謀る、ジョナサン:毒薬の証拠をつかむために食屍鬼街へ・チンピラに襲われる
2巻
ジョナサンvsスピードワゴン、ジョナサン:毒薬の証拠をつかむ、ディオ:石仮面の秘密を知る、ジョナサン:ジョースター邸でディオの悪事を暴露、ディオ吸血鬼化する、ジョジョvsディオ(ジョースター邸)、ジョナサン:エリナとの再会
3巻
ディオ:切り裂きジャックを下僕にする、ツェペリ男爵登場・ジョナサン波紋を教わる、ディオを追いウインドナイツ・ロットへ、ツェペリvs切り裂きジャック、ジョナサンvs切り裂きジャック、ジョナサン・ツェペリvsディオ(気化冷凍法)、タルカスとブラフォード
4巻
ジョナサンvsブラフォード、ジョナサンvsタルカス、ポコが扉を開く、ツェペリ死亡、トンペティ・ダイアー・ストレイツォ登場
5巻
ジョナサンvsディオ決着、第一部完、第二部へ、ジョセフ・ジョースター登場、ストレイツォの裏切り