波の国任務(再不斬編)
1-4巻
中忍試験
5-13巻
木の葉崩し(大蛇丸編)
14-16巻
三すくみの闘い(綱手登場・大蛇丸編)
17-19巻
サスケ奪還任務・カカシ外伝(vs音隠れ・君麻呂)
20-27巻
青年編 ナルト疾風伝
風影奪還任務(vsサソリ・デイダラ)
28-31
天地橋任務(サイ・ヤマト登場)
32-34
新たなる刺客(vs飛段・角都)
35-38巻
それぞれの捜索(長門編開始、サスケvsイタチ)
39-43巻
次なる暁の動き・ペインの侵攻(ビー登場・長門編決着)
44-48巻
五影と暁
49-54巻
第四次忍界大戦 前編
55-65巻
第四次忍界大戦 後編(サスケ合流後)
66-72巻