1巻
エド＆アル登場、リオールで教主のインチキを暴く、ラスト＆グラトニー登場、ユースウェル炭鉱をヨキ中尉から取り上げる、ロイ・マスタング登場
2巻
タッカーの家で合成獣を目にする、スカー登場、エンヴィー登場、エド＆アルvsスカー、アームストロング登場、マルコー登場、ラスト：マルコーを脅迫
3巻
エド＆アル：リゼンブールへ帰郷、ウィンリィ＆ピナコ登場、機械鎧の修復、エド＆アル：中央へ、図書館全焼、司書シェスカに会う、賢者の石の材料を知る、元・第五研究所へ潜入、アルvs No.66（バリー）、エドvs No.48（スライサー）、バリー：アルに「人工物だ」と吹き込む、外伝「軍部祭り（エドvsロイ）」
4巻
エド：エンヴィー＆ラストと対面、第五研究所崩壊、バリー逃亡、キンブリー初登場、ウィンリィ：ヒューズ家に招かれる、アル：自分の記憶を疑う・エドと過去の記憶を話し合う、大総統登場、ヒューズの最期、スカー：グラトニーに敗北・貧民街へ流れ着く、外伝「軍の犬？（ブラックハヤテ号）」